Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM74Q96NL1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM74Q96NL1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM74Q96NL1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM74Q96NL1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms