Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00167Q96N53 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00167Q96N53 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00167Q96N53 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms