Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00052Q96N35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00052Q96N35 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00052Q96N35 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00052Q96N35 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms