Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI9

CXorf58, Putative uncharacterized protein CXorf58, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf58Q96LI9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXorf58Q96LI9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXorf58Q96LI9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXorf58Q96LI9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms