Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I2Q96KJ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I2Q96KJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I2Q96KJ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I2Q96KJ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms