Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3YL1Q96HL8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3YL1Q96HL8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3YL1Q96HL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3YL1Q96HL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms