Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC34Q96HJ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC34Q96HJ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms