Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN37Q96GY3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN37Q96GY3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN37Q96GY3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN37Q96GY3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms