Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALML4Q96GE6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CALML4Q96GE6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CALML4Q96GE6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CALML4Q96GE6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CALML4Q96GE6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms