Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF31Q96EP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF31Q96EP0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF31Q96EP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms