Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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FAM3DQ96BQ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM3DQ96BQ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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FAM3DQ96BQ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FAM3DQ96BQ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FAM3DQ96BQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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FAM3DQ96BQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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FAM3DQ96BQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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FAM3DQ96BQ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3DQ96BQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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FAM3DQ96BQ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3DQ96BQ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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