Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMAQ96B86 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGMAQ96B86 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGMAQ96B86 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMAQ96B86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGMAQ96B86 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMAQ96B86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGMAQ96B86 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms