Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CTTNBP2Q8WZ74 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
CTTNBP2Q8WZ74 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CTTNBP2Q8WZ74 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CTTNBP2Q8WZ74 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CTTNBP2Q8WZ74 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.05■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CTTNBP2Q8WZ74 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms