Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDM1Q8TC05 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM1Q8TC05 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM1Q8TC05 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms