Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB3IL1Q8TBN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB3IL1Q8TBN0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3IL1Q8TBN0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3IL1Q8TBN0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms