Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
C17orf47Q8NEP4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C17orf47Q8NEP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C17orf47Q8NEP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms