Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KSR1Q8IVT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KSR1Q8IVT5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KSR1Q8IVT5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KSR1Q8IVT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KSR1Q8IVT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms