Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX32Q86XE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX32Q86XE0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX32Q86XE0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX32Q86XE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX32Q86XE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms