Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG3Q86VR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG3Q86VR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG3Q86VR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG3Q86VR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG3Q86VR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG3Q86VR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RETREG3Q86VR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RETREG3Q86VR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms