Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH3RF1Q7Z6J0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF1Q7Z6J0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3RF1Q7Z6J0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms