Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP49Q70CQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP49Q70CQ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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USP49Q70CQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP49Q70CQ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP49Q70CQ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP49Q70CQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP49Q70CQ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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