Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNI2Q6ZMN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNI2Q6ZMN8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNI2Q6ZMN8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms