Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPTNQ6XPR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms