Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CSAG1Q6PB30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CSAG1Q6PB30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CSAG1Q6PB30 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms