Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf140Q5VVS0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf140Q5VVS0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms