Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACHD1Q5VU97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACHD1Q5VU97 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACHD1Q5VU97 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACHD1Q5VU97 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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