Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SPANXN1Q5VSR9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPANXN1Q5VSR9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPANXN1Q5VSR9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms