Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC183Q5T5S1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC183Q5T5S1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC183Q5T5S1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC183Q5T5S1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms