Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP2LQ5T4T6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2LQ5T4T6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2LQ5T4T6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2LQ5T4T6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms