Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms