Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM74A1Q5RGS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM74A1Q5RGS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A1Q5RGS3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms