Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRF1Q16656 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRF1Q16656 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRF1Q16656 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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