Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18Q15532 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18Q15532 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18Q15532 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18Q15532 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SS18Q15532 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18Q15532 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18Q15532 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18Q15532 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SS18Q15532 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SS18Q15532 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SS18Q15532 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18Q15532 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SS18Q15532 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SS18Q15532 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18Q15532 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18Q15532 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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