Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL3Q13618 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUL3Q13618 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL3Q13618 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL3Q13618 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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