Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB3BPQ13352 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB3BPQ13352 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB3BPQ13352 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB3BPQ13352 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms