Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC15Q0P6D6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC15Q0P6D6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms