Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD47Q08722 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD47Q08722 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD47Q08722 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD47Q08722 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD47Q08722 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD47Q08722 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD47Q08722 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD47Q08722 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD47Q08722 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD47Q08722 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD47Q08722 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD47Q08722 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD47Q08722 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD47Q08722 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD47Q08722 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD47Q08722 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD47Q08722 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD47Q08722 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD47Q08722 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD47Q08722 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD47Q08722 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD47Q08722 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD47Q08722 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD47Q08722 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD47Q08722 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD47Q08722 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD47Q08722 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD47Q08722 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD47Q08722 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD47Q08722 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD47Q08722 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD47Q08722 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD47Q08722 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD47Q08722 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD47Q08722 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD47Q08722 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD47Q08722 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD47Q08722 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD47Q08722 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD47Q08722 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD47Q08722 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD47Q08722 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD47Q08722 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD47Q08722 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD47Q08722 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD47Q08722 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD47Q08722 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD47Q08722 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD47Q08722 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD47Q08722 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD47Q08722 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD47Q08722 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD47Q08722 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD47Q08722 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD47Q08722 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD47Q08722 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD47Q08722 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD47Q08722 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD47Q08722 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD47Q08722 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD47Q08722 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD47Q08722 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD47Q08722 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD47Q08722 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD47Q08722 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD47Q08722 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD47Q08722 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD47Q08722 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD47Q08722 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms