Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DDR1Q08345 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DDR1Q08345 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DDR1Q08345 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDR1Q08345 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDR1Q08345 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms