Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLEQ07864 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLEQ07864 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLEQ07864 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLEQ07864 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLEQ07864 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLEQ07864 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLEQ07864 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLEQ07864 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLEQ07864 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLEQ07864 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLEQ07864 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLEQ07864 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLEQ07864 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLEQ07864 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLEQ07864 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLEQ07864 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLEQ07864 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLEQ07864 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLEQ07864 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLEQ07864 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLEQ07864 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLEQ07864 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLEQ07864 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLEQ07864 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLEQ07864 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLEQ07864 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLEQ07864 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLEQ07864 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLEQ07864 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLEQ07864 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLEQ07864 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLEQ07864 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLEQ07864 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLEQ07864 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLEQ07864 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLEQ07864 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLEQ07864 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLEQ07864 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLEQ07864 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLEQ07864 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLEQ07864 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLEQ07864 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLEQ07864 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLEQ07864 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLEQ07864 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLEQ07864 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLEQ07864 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLEQ07864 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLEQ07864 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLEQ07864 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLEQ07864 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLEQ07864 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLEQ07864 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLEQ07864 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLEQ07864 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLEQ07864 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLEQ07864 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLEQ07864 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLEQ07864 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLEQ07864 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLEQ07864 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLEQ07864 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLEQ07864 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLEQ07864 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POLEQ07864 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLEQ07864 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLEQ07864 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLEQ07864 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLEQ07864 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLEQ07864 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLEQ07864 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLEQ07864 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLEQ07864 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLEQ07864 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLEQ07864 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLEQ07864 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLEQ07864 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLEQ07864 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLEQ07864 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLEQ07864 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLEQ07864 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLEQ07864 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLEQ07864 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLEQ07864 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLEQ07864 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLEQ07864 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLEQ07864 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLEQ07864 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLEQ07864 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLEQ07864 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLEQ07864 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLEQ07864 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms