Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 YOR012WYOR012W 414 nt7.13□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 ERV2YPR037C 591 nt7.13□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 ORM1YGR038W 669 nt7.12□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 YLR358CYLR358C 564 nt7.12□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 MRPL24YMR193W 777 nt7.12□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 YPL168WYPL168W 1293 nt7.12□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 YOR389WYOR389W 1875 nt7.11□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 SKP1YDR328C 585 nt7.11□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 SNF4YGL115W 969 nt7.11□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 URA1YKL216W 945 nt7.11□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 YMR114CYMR114C 1107 nt7.11□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 DSC3YOR223W 879 nt7.11□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 NUP84YDL116W 2181 nt7.1□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 RDR1YOR380W 1641 nt7.1□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 NCA3YJL116C 1014 nt7.1□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 YNR048WYNR048W 1182 nt7.1□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 OSM1YJR051W 1506 nt7.1□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 SNU71YGR013W 1863 nt7.09□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 GUT1YHL032C 2130 nt7.09□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 PAC10YGR078C 600 nt7.09□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 PUP2YGR253C 783 nt7.09□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 SSC1YJR045C 1965 nt7.09□□□□□ -1.27
CDA1Q06702 SEC23YPR181C 2307 nt7.09□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 YCR041WYCR041W 333 nt7.08□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 HHY1YEL059W 309 nt7.08□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 YHR140WYHR140W 720 nt7.08□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 STS1YIR011C 960 nt7.08□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 TRR1YDR353W 960 nt7.07□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 YJR142WYJR142W 1029 nt7.07□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 snR34snR34 203 nt7.07□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 LAT1YNL071W 1449 nt7.07□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 EFM1YHL039W 1758 nt7.07□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 CDC7YDL017W 1524 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 AI3Q0060 1248 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 AIM2YAL049C 741 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 YLR112WYLR112W 420 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 AVO2YMR068W 1281 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 YOL079WYOL079W 399 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 CDS1YBR029C 1374 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 KIN1YDR122W 3195 nt7.06□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 CDC3YLR314C 1563 nt7.05□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 REV7YIL139C 738 nt7.05□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 DBR1YKL149C 1218 nt7.04□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 YLR036CYLR036C 612 nt7.04□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 OST3YOR085W 1053 nt7.04□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 MAD2YJL030W 591 nt7.03□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 SED5YLR026C 1023 nt7.03□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 CCW12YLR110C 402 nt7.03□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 YMR074CYMR074C 438 nt7.03□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 TIF34YMR146C 1044 nt7.03□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 RQC1YDR333C 2172 nt7.03□□□□□ -1.28
CDA1Q06702 ICL2YPR006C 1728 nt7.02□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 CDC10YCR002C 969 nt7.02□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 HRB1YNL004W 1365 nt7.02□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 PGI1YBR196C 1665 nt7.02□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 CRN1YLR429W 1956 nt7.02□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.01□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 YBR138CYBR138C 1575 nt7□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 NMA2YGR010W 1188 nt7□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 MEU1YLR017W 1014 nt7□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 ERG27YLR100W 1044 nt7□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 EDC3YEL015W 1656 nt7□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.99□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.99□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 SPC24YMR117C 642 nt6.99□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 SUN4YNL066W 1263 nt6.99□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt6.98□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 ISR1YPR106W 1332 nt6.98□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 TRP1YDR007W 675 nt6.97□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 PIH1YHR034C 1035 nt6.97□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 RSA3YLR221C 663 nt6.97□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 YOX1YML027W 1158 nt6.97□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 PHO85YPL031C 918 nt6.97□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 DIT1YDR403W 1611 nt6.97□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 CMK2YOL016C 1344 nt6.97□□□□□ -1.29
CDA1Q06702 PET117YER058W 324 nt6.96□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 PIL1YGR086C 1020 nt6.96□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 PTC7YHR076W 1032 nt6.96□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 ERP5YHR110W 639 nt6.96□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 YOR111WYOR111W 699 nt6.96□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 YGL081WYGL081W 963 nt6.95□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 YJL213WYJL213W 996 nt6.95□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 REX3YLR107W 1215 nt6.95□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 UBC12YLR306W 567 nt6.95□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 DMC1YER179W 1005 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 MMS2YGL087C 414 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 YJL144WYJL144W 315 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 ISY1YJR050W 708 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 SRL2YLR082C 1179 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 YLR311CYLR311C 348 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 SNT309YPR101W 528 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 FES1YBR101C 873 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 GPH1YPR160W 2709 nt6.94□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 IRC5YFR038W 2562 nt6.93□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 CYB2YML054C 1776 nt6.93□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 CTA1YDR256C 1548 nt6.93□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 YJR115WYJR115W 510 nt6.93□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 MSI1YBR195C 1269 nt6.93□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 MCH2YKL221W 1422 nt6.93□□□□□ -1.3
CDA1Q06702 DOC1YGL240W 753 nt6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms