Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POU3F1Q03052 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU3F1Q03052 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POU3F1Q03052 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms