Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS35P82673 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPS35P82673 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS35P82673 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms