Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HBBP68871 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HBBP68871 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HBBP68871 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HBBP68871 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HBBP68871 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HBBP68871 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HBBP68871 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HBBP68871 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HBBP68871 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HBBP68871 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HBBP68871 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HBBP68871 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HBBP68871 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HBBP68871 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HBBP68871 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBBP68871 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HBBP68871 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBBP68871 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBBP68871 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBBP68871 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HBBP68871 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBBP68871 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBBP68871 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBBP68871 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBBP68871 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBBP68871 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HBBP68871 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBBP68871 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBBP68871 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBBP68871 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBBP68871 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBBP68871 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HBBP68871 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBBP68871 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBBP68871 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBBP68871 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBBP68871 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HBBP68871 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HBBP68871 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HBBP68871 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HBBP68871 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HBBP68871 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBBP68871 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBBP68871 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBBP68871 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBBP68871 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBBP68871 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBBP68871 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBBP68871 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBBP68871 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBBP68871 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HBBP68871 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HBBP68871 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBBP68871 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBBP68871 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBBP68871 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBBP68871 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBBP68871 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBBP68871 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBBP68871 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms