Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
UBE2HP62256 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE2HP62256 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2HP62256 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2HP62256 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2HP62256 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms