Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN18P56856 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN18P56856 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN18P56856 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms