Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAPAP54920 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAPAP54920 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAPAP54920 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAPAP54920 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NAPAP54920 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NAPAP54920 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAPAP54920 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAPAP54920 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAPAP54920 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAPAP54920 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAPAP54920 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NAPAP54920 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NAPAP54920 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NAPAP54920 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NAPAP54920 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NAPAP54920 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NAPAP54920 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NAPAP54920 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NAPAP54920 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NAPAP54920 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAPAP54920 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NAPAP54920 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAPAP54920 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAPAP54920 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAPAP54920 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NAPAP54920 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAPAP54920 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAPAP54920 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NAPAP54920 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NAPAP54920 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAPAP54920 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAPAP54920 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAPAP54920 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAPAP54920 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAPAP54920 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAPAP54920 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAPAP54920 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAPAP54920 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NAPAP54920 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NAPAP54920 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NAPAP54920 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NAPAP54920 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NAPAP54920 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NAPAP54920 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NAPAP54920 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAPAP54920 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAPAP54920 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAPAP54920 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAPAP54920 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NAPAP54920 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAPAP54920 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAPAP54920 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAPAP54920 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAPAP54920 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NAPAP54920 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NAPAP54920 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NAPAP54920 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NAPAP54920 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NAPAP54920 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NAPAP54920 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NAPAP54920 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NAPAP54920 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAPAP54920 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAPAP54920 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NAPAP54920 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAPAP54920 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NAPAP54920 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NAPAP54920 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NAPAP54920 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAPAP54920 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAPAP54920 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAPAP54920 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAPAP54920 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAPAP54920 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAPAP54920 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NAPAP54920 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAPAP54920 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAPAP54920 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAPAP54920 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAPAP54920 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAPAP54920 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAPAP54920 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAPAP54920 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAPAP54920 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAPAP54920 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAPAP54920 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAPAP54920 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAPAP54920 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAPAP54920 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAPAP54920 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAPAP54920 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAPAP54920 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAPAP54920 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAPAP54920 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAPAP54920 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAPAP54920 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NAPAP54920 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NAPAP54920 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NAPAP54920 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms