Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR4P51679 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR4P51679 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR4P51679 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR4P51679 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR4P51679 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR4P51679 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR4P51679 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR4P51679 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR4P51679 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCR4P51679 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR4P51679 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR4P51679 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR4P51679 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR4P51679 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR4P51679 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR4P51679 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR4P51679 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR4P51679 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR4P51679 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR4P51679 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR4P51679 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR4P51679 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR4P51679 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR4P51679 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR4P51679 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR4P51679 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR4P51679 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR4P51679 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR4P51679 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR4P51679 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR4P51679 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR4P51679 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR4P51679 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR4P51679 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR4P51679 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR4P51679 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR4P51679 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR4P51679 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR4P51679 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR4P51679 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCR4P51679 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR4P51679 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR4P51679 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR4P51679 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR4P51679 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR4P51679 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR4P51679 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR4P51679 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR4P51679 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR4P51679 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCR4P51679 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR4P51679 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR4P51679 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR4P51679 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR4P51679 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCR4P51679 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR4P51679 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR4P51679 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR4P51679 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCR4P51679 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR4P51679 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR4P51679 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR4P51679 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR4P51679 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR4P51679 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCR4P51679 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR4P51679 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR4P51679 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR4P51679 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCR4P51679 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR4P51679 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR4P51679 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCR4P51679 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCR4P51679 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms