Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC4A3P48751 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC4A3P48751 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC4A3P48751 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC4A3P48751 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC4A3P48751 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC4A3P48751 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC4A3P48751 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC4A3P48751 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms