Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AMTP48728 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMTP48728 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMTP48728 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMTP48728 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMTP48728 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMTP48728 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMTP48728 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMTP48728 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMTP48728 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMTP48728 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMTP48728 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMTP48728 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AMTP48728 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMTP48728 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AMTP48728 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMTP48728 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMTP48728 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMTP48728 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMTP48728 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMTP48728 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMTP48728 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMTP48728 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMTP48728 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMTP48728 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AMTP48728 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AMTP48728 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AMTP48728 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AMTP48728 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AMTP48728 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AMTP48728 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AMTP48728 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AMTP48728 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AMTP48728 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AMTP48728 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AMTP48728 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMTP48728 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMTP48728 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMTP48728 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMTP48728 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AMTP48728 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AMTP48728 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMTP48728 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMTP48728 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMTP48728 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMTP48728 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMTP48728 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AMTP48728 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMTP48728 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMTP48728 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMTP48728 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMTP48728 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMTP48728 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMTP48728 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMTP48728 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMTP48728 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AMTP48728 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMTP48728 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMTP48728 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMTP48728 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms