Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME1P48163 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ME1P48163 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ME1P48163 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME1P48163 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME1P48163 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME1P48163 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME1P48163 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME1P48163 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ME1P48163 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME1P48163 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME1P48163 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME1P48163 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME1P48163 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ME1P48163 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ME1P48163 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ME1P48163 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ME1P48163 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ME1P48163 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ME1P48163 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ME1P48163 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ME1P48163 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ME1P48163 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ME1P48163 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ME1P48163 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ME1P48163 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ME1P48163 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ME1P48163 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ME1P48163 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ME1P48163 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME1P48163 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ME1P48163 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME1P48163 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME1P48163 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ME1P48163 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ME1P48163 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME1P48163 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME1P48163 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME1P48163 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME1P48163 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME1P48163 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ME1P48163 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ME1P48163 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ME1P48163 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ME1P48163 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME1P48163 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME1P48163 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME1P48163 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME1P48163 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME1P48163 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ME1P48163 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME1P48163 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME1P48163 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME1P48163 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME1P48163 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME1P48163 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ME1P48163 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME1P48163 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME1P48163 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms